O Centro de Controle de Tráfego (CCT) da Via Lagos monitora e controla todos os serviços de manutenção e operações que ocorrem na rodovia. É do CCT que partem os acionamentos das equipes de atendimento médico e mecânico do SOS Usuário.

O atendimento é feito 24 horas por dia e as equipes e viaturas são distribuídas em bases e pontos estratégicos conforme as demandas do tráfego. As bases operacionais fixas da Via Lagos estão no km 22, Latino Melo - Rio Bonito, e no km 40,5, Araruama.

O CCT da Via Lagos possui o SAT - sistema de contagem de veículos - nos principais acessos: no km 0 (entrada e saída para a BR 101); no km 22 (entrada e saída para Saquarema e RJ-106); no Km 30 (entrada e saída para Araruama); e no km 56 (entrada e saída para São Pedro da Aldeia).

O CCT opera também estações meteorológicas, para verificação das condições climáticas ao longo da rodovia; um sistema de rádio-comunicação, para o acionamento das equipes de pista; e recebe as ligações do serviço de emergência 0800 70 20 124.

Todas as ocorrências, anormalidades e incidentes ocorridos na rodovia são lançados no sistema de ocorrências controlado pelo CCT.